40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2906 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  73.23 
 
 
254 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.06 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.33 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.92 
 
 
1480 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.48 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  27.17 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.16 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
629 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.6 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  24 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.6 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  25.81 
 
 
235 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  32.3 
 
 
1631 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.24 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.31 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  26.25 
 
 
275 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.22 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.96 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 
119 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.25 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.25 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.25 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.25 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.25 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 
119 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.99 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.29 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
129 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.71 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.43 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.45 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.32 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1317  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.85 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242931  hitchhiker  0.00262131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.73 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.27 
 
 
223 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.16 
 
 
119 aa  42  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  25.77 
 
 
245 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  25.77 
 
 
245 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>