More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5209 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5209  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.422684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1159  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.24 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  39.3 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 294 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  38.36 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  36.22 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06394  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  39.66 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.55 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.55 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  38.72 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  38.72 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  38.89 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  35.86 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  38.46 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  36.09 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.09 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.47 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2091  transcriptional regulator for glycerol-3-phosphate regulon, DeoR family protein  36.73 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.402704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.93 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  37.07 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  35.77 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.89 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  34.39 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.06 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.06 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.06 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.39 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  34.39 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.2 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.65 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.65 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.65 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.65 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.65 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.8 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>