More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4860 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4860  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
453 aa  929    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.605322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3672  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  94.26 
 
 
453 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6070  Galactonate dehydratase  50.79 
 
 
474 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430107  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.49 
 
 
494 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940832  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.29 
 
 
405 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.76 
 
 
425 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2579  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.89 
 
 
405 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.84 
 
 
417 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1145  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.76 
 
 
412 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.71 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.49 
 
 
412 aa  213  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1155  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.98 
 
 
412 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4859  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.98 
 
 
399 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156633  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3673  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.73 
 
 
399 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406151  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.01 
 
 
423 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.89 
 
 
428 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.967336  normal  0.603396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2242  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.49 
 
 
412 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.464149  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1300  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
412 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4480  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.69 
 
 
409 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.13 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.68 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.13 
 
 
400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.79 
 
 
405 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  29.71 
 
 
400 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  29.71 
 
 
400 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  29.9 
 
 
382 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2909  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.54 
 
 
415 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.81 
 
 
386 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.43 
 
 
384 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  29.4 
 
 
400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  28.5 
 
 
384 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.31 
 
 
396 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  28.78 
 
 
381 aa  156  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  29.71 
 
 
400 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  29.71 
 
 
400 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.05 
 
 
396 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.51 
 
 
396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.05 
 
 
396 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.82 
 
 
400 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 
382 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.32 
 
 
400 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 
391 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.49 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.62 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.86 
 
 
388 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0789  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 
419 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.32 
 
 
382 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.63 
 
 
398 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  28.88 
 
 
382 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.85 
 
 
405 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.25 
 
 
394 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.97 
 
 
393 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.87 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.33 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.99 
 
 
391 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.65 
 
 
415 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  29.37 
 
 
385 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1665  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.34 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0687285  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.99 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.36 
 
 
388 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  27.7 
 
 
382 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.61 
 
 
388 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  27.94 
 
 
382 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5534  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.25 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.14 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.63 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.66 
 
 
382 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  27.66 
 
 
401 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  28.02 
 
 
381 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  27.58 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.75 
 
 
393 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  27.38 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  26.99 
 
 
382 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  27.18 
 
 
382 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.67 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  26.43 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  27.78 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  27.19 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  29.4 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.95 
 
 
406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  27.78 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  28.35 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  27.42 
 
 
382 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  27.19 
 
 
382 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  27.19 
 
 
382 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  29.87 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4210  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  27.14 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  26.84 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  28.35 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  26.63 
 
 
378 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.01 
 
 
392 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  26.05 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>