More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4210 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4210  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 402 aa  816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3623  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.11 
 
 		 404 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.498648  normal  0.36382 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.82 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5534  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.71 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.03 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.46 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3341  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.4 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1460  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.48 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  31.81 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  31.81 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  31.81 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.43 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  32.9 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  30.28 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  32.47 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  31.92 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  30.28 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  30.79 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.63 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  30.67 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  30.91 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  30.15 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  30.69 
 
 		 382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  30.91 
 
 		 382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  30.33 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  31.47 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  30.33 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.65 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  30.48 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  30.1 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.85 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  31.08 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  30.58 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.85 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.91 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  30.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  30.6 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  30.6 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  30.6 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  30.6 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.43 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  29.57 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.61 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  29.57 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  29.57 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  30.35 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  31.58 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.24 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.79 
 
 		 423 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  31.33 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.24 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  28.71 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  28.5 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  29.47 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  29.47 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  29.7 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.63 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.17 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  28.83 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  26.88 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  28.9 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.43 
 
 		 381 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3772  galactonate dehydratase  28.83 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.15 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.64 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  29.72 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  28.86 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  29.72 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  29.44 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  29.01 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  29.72 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  28.47 
 
 		 378 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3574  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.06 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410724  normal  0.113329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.65 
 
 		 388 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.32 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.1 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.18 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  28.93 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  29.47 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.41 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000550231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.33 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0120  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.57 
 
 		 377 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102708  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  27.32 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.96 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.2 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.96 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>