More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3761 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.56 
 
 		 400 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 401 aa  832    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  71.54 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3341  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.68 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5534  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.12 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3623  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.498648  normal  0.36382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4210  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.46 
 
 		 402 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1460  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.22 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.25 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.72 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.46 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.38 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  33.16 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  29.7 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.5 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.25 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  31.27 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.68 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  30.24 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  30.24 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  32.39 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.02 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  30.35 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  30.45 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.5 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  30.24 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  29.95 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  30 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  30.24 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  30.81 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.43 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.17 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.13 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.4 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.45 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.22 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  31.38 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.27 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.25 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.69 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.45 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  31.47 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.68 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.75 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  31.03 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  30.17 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.64 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  31.11 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  30 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.93 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.08 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  29.41 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  29.14 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  29.41 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  29.41 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  29.14 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  29.41 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.08 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.08 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  29.31 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  30.71 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  29.16 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.48 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  29.08 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  29.97 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.34 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.36 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  29.97 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  29.97 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.72 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  28.83 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.23 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  27.88 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  30.1 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  28.9 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  28.9 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  32.07 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.07 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.46 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.6 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  29.68 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  29.68 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  29.68 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.58 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2909  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.34 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.119891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>