More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2285 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
342 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.287926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7823  putative ABC transporter, permease protein  68.41 
 
 
345 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
306 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  35.35 
 
 
306 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
303 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
283 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
278 aa  126  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
278 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
283 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  32.13 
 
 
278 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
280 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
281 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
293 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
278 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
289 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
289 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
289 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
289 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
319 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  28.05 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
279 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
285 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
275 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  33.89 
 
 
275 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
276 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
282 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  26.18 
 
 
277 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.65 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  25 
 
 
291 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  25 
 
 
291 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
275 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
274 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
275 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
283 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
311 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
281 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
274 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
276 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
283 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
302 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
284 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
275 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  25.87 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
277 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
283 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
283 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
253 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
283 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.98 
 
 
283 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 
276 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 
275 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  24.92 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0633  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2467  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0081  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
298 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0874  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
288 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0878  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
288 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  31.95 
 
 
275 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
275 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  31.95 
 
 
275 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  26.52 
 
 
277 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0917  putative ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
276 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.693648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
283 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644522  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
277 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  35.4 
 
 
292 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  25.59 
 
 
277 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
311 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0143225  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0722  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  24.47 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409325  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
278 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
273 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
299 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.61 
 
 
288 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180177  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
286 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
285 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
286 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>