More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6340 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6340  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 281 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4862  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.463107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1391  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2454  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  31.41 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4748  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.22 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.140689  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.86 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  29.28 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.42 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.28 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.16 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.6 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.6 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.36 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.6 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.15 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.16 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.21 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.52 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.68 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.63 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.52 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.52 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.52 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  24.54 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.07 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.52 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.07 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.63 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.52 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.52 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.39 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1262  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7393  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.12 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6570  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.54 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.33 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6175  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0488748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2743  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0284405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  24.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  27.44 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  27.21 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.09 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0156  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>