More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3243 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3243  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  53.46 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.12 
 
 		 255 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 		 255 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 255 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.12 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.5 
 
 		 264 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  41.56 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.02 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  35.69 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 255 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  35.55 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  36.86 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  35.92 
 
 		 262 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  35.1 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  39.04 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  37.35 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  35 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  34.41 
 
 		 490 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  37.34 
 
 		 255 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  35.71 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  29.23 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  37.34 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  35.25 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  35.54 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  27.49 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  40.89 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  40.52 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 264 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.13 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  32.07 
 
 		 494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  33.78 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  37.1 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  35.4 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  34.03 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.82 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  37.33 
 
 		 265 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 265 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 265 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.33 
 
 		 265 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  31.15 
 
 		 264 aa  131  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  35.95 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  36.84 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 295 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  35.68 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  32.68 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  31.05 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  33.2 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  35.77 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.72 
 
 		 418 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  33.78 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  35.77 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  34.23 
 
 		 272 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 275 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.09 
 
 		 265 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.09 
 
 		 265 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.09 
 
 		 265 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  34.38 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.09 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  33.47 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  38.75 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  34.6 
 
 		 444 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  35.79 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  40.09 
 
 		 271 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>