More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3169 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3169  pyruvate kinase  100 
 
 		 492 aa  990    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2956  pyruvate kinase  77.46 
 
 		 502 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2327  pyruvate kinase  93.5 
 
 		 492 aa  936    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2513  pyruvate kinase  83.74 
 
 		 492 aa  835    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1376  pyruvate kinase  53.23 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5923  pyruvate kinase  54.57 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0497  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 508 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.57458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1848  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 508 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3178  pyruvate kinase  53.75 
 
 		 632 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0262  pyruvate kinase  53.97 
 
 		 621 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0632  pyruvate kinase  53.31 
 
 		 622 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.830733  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0749  pyruvate kinase  51.78 
 
 		 617 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0897  pyruvate kinase  51.78 
 
 		 624 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15310  pyruvate kinase  53.73 
 
 		 601 aa  234  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0375407  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3917  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 626 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0371  pyruvate kinase  49.02 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339811  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0383  pyruvate kinase  49.02 
 
 		 615 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0146444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0392  pyruvate kinase  49.02 
 
 		 615 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3252  pyruvate kinase  43.49 
 
 		 626 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3098  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 659 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  28.81 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  34.62 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  31.27 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  31.27 
 
 		 461 aa  140  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  28.85 
 
 		 488 aa  139  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  30.35 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  32.28 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  32.28 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 569 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  32.39 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  31.99 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  32.09 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  31.02 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  31.44 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  34.04 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  30 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  34.02 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  34.02 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  31.56 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  27.56 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  31.56 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  30.97 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  30.77 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  30.48 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  30.7 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  31.56 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  31.4 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  31.32 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  30 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  31.43 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  30.98 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  30.81 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  30.81 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  31.21 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  31.43 
 
 		 473 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  30.73 
 
 		 492 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  30.9 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  31.37 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  31.62 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  30 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  29.29 
 
 		 572 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  31.9 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  31.58 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  32.17 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  32.47 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  30.64 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  33.43 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  33.72 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1356  pyruvate kinase  30.91 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000703593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  29.66 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  32.47 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  30.05 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83166  pyruvate kinase  29.38 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  33.43 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0441  pyruvate kinase  28.81 
 
 		 480 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  31.58 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  32.13 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  27.32 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  29.21 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  29.97 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  29.83 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  29.79 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  27.57 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  31.12 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  29.74 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  29.91 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  30.41 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  30.12 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  28.74 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  28.74 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  28.85 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  29.6 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  28.3 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0415  pyruvate kinase  26.61 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0248117  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  31.86 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  29.16 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1561  pyruvate kinase  28.69 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  30.86 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  33.43 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1566  pyruvate kinase  27.41 
 
 		 480 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>