More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3252 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3917  pyruvate kinase  61.43 
 
 
626 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3252  pyruvate kinase  100 
 
 
626 aa  1290    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0262  pyruvate kinase  46.13 
 
 
621 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674284  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3178  pyruvate kinase  44.89 
 
 
632 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0371  pyruvate kinase  44.97 
 
 
615 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339811  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0383  pyruvate kinase  44.81 
 
 
615 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0146444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0392  pyruvate kinase  44.81 
 
 
615 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0632  pyruvate kinase  46.71 
 
 
622 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.830733  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15310  pyruvate kinase  42.16 
 
 
601 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0375407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0897  pyruvate kinase  40.17 
 
 
624 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0749  pyruvate kinase  40.34 
 
 
617 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1376  pyruvate kinase  43.61 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615881  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3098  pyruvate kinase  33.1 
 
 
659 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2513  pyruvate kinase  49.4 
 
 
492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5923  pyruvate kinase  49.21 
 
 
502 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2956  pyruvate kinase  49 
 
 
502 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3169  pyruvate kinase  43.67 
 
 
492 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2327  pyruvate kinase  43.33 
 
 
492 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150896  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1848  pyruvate kinase  46.56 
 
 
508 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0497  pyruvate kinase  46.15 
 
 
508 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.57458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  32.82 
 
 
578 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0562  pyruvate kinase  33.73 
 
 
585 aa  123  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  31.53 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2510  pyruvate kinase  31.18 
 
 
581 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.812521 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  30.8 
 
 
479 aa  122  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  33.47 
 
 
582 aa  122  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  31.25 
 
 
580 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1475  pyruvate kinase  33.71 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  33.11 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  33.07 
 
 
586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  29.23 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  33.74 
 
 
581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  29.64 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  28.53 
 
 
487 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  32 
 
 
583 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  31.42 
 
 
473 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  28.53 
 
 
492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  32.79 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  31.18 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  32.79 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  31.02 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  32.5 
 
 
583 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  27.67 
 
 
488 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  30.3 
 
 
476 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  37.56 
 
 
569 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  31.44 
 
 
470 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  33.93 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0544  pyruvate kinase  30.47 
 
 
450 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  31.29 
 
 
480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  28.53 
 
 
492 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  31.15 
 
 
470 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf034  pyruvate kinase  27.74 
 
 
472 aa  111  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  31.76 
 
 
491 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  28.13 
 
 
478 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  28.75 
 
 
478 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  29.29 
 
 
482 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  31.69 
 
 
472 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  29.26 
 
 
472 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  29.26 
 
 
472 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  31.06 
 
 
473 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  31.75 
 
 
472 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  32.1 
 
 
596 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  30.42 
 
 
580 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  29.87 
 
 
471 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  31.1 
 
 
572 aa  108  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  30.38 
 
 
475 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  32.35 
 
 
475 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  32.06 
 
 
475 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  31.69 
 
 
597 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  29.9 
 
 
481 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  28.84 
 
 
488 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  28.38 
 
 
590 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0990  pyruvate kinase  30.4 
 
 
492 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00681712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  28.79 
 
 
472 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  31.23 
 
 
590 aa  107  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0479  pyruvate kinase  29.96 
 
 
483 aa  107  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  30.29 
 
 
585 aa  107  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  29.64 
 
 
474 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  28.79 
 
 
472 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  29.75 
 
 
472 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  29.75 
 
 
472 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  31.02 
 
 
596 aa  107  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  29.75 
 
 
472 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  28.48 
 
 
488 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  30.82 
 
 
587 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  30.38 
 
 
482 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  33.63 
 
 
477 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  30.82 
 
 
479 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  31.47 
 
 
482 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  31.53 
 
 
461 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  30.83 
 
 
477 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1561  pyruvate kinase  31.95 
 
 
478 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  30.56 
 
 
585 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  28.34 
 
 
478 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  31.44 
 
 
470 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  29.35 
 
 
474 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  30.91 
 
 
478 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  29.24 
 
 
582 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  29.19 
 
 
509 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  30.34 
 
 
477 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>