More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2959 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  100 
 
 
477 aa  971    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  65.96 
 
 
481 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  63.64 
 
 
473 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  62.79 
 
 
473 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  59.21 
 
 
485 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  55.46 
 
 
485 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  51.46 
 
 
474 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  51.46 
 
 
475 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  47.71 
 
 
477 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  45.36 
 
 
465 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  45.32 
 
 
477 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  44.21 
 
 
477 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  48.3 
 
 
499 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  43.79 
 
 
477 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.28 
 
 
584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  46.02 
 
 
585 aa  349  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  42.89 
 
 
583 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.16 
 
 
578 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  342  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41 
 
 
485 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.78 
 
 
485 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.47 
 
 
582 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.31 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  41.23 
 
 
580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  45.93 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  41.26 
 
 
477 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.17 
 
 
583 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.72 
 
 
483 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.29 
 
 
509 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  45.32 
 
 
585 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  45.08 
 
 
585 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  45.08 
 
 
585 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.91 
 
 
596 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.98 
 
 
592 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.98 
 
 
592 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  44.84 
 
 
585 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  39.91 
 
 
596 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  43.44 
 
 
583 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  41.67 
 
 
582 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  42.58 
 
 
587 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  39.91 
 
 
597 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.9 
 
 
479 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  43.19 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.11 
 
 
472 aa  329  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.11 
 
 
590 aa  329  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.62 
 
 
478 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  42.69 
 
 
478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.83 
 
 
596 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42 
 
 
577 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  39.45 
 
 
494 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  40.35 
 
 
605 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  39.15 
 
 
480 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  40.59 
 
 
594 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  40.53 
 
 
482 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  39.74 
 
 
580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  41.61 
 
 
587 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  44.37 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  39.87 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  40.93 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  42.96 
 
 
479 aa  320  5e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  41.25 
 
 
472 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  42.23 
 
 
601 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  38.99 
 
 
474 aa  319  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.67 
 
 
600 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  43.41 
 
 
478 aa  319  7.999999999999999e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  40.97 
 
 
580 aa  319  9e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  41.47 
 
 
589 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  44.13 
 
 
474 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.33 
 
 
590 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  39.87 
 
 
581 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  40.09 
 
 
472 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  43.59 
 
 
471 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.41 
 
 
476 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  42.59 
 
 
470 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  42.33 
 
 
471 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  44.47 
 
 
474 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  42.35 
 
 
470 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.99 
 
 
472 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  42.13 
 
 
479 aa  316  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  38.9 
 
 
482 aa  315  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.99 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  41.04 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  42.42 
 
 
582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  40.51 
 
 
473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.87 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  40.14 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  37.86 
 
 
580 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  39.44 
 
 
585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  39.36 
 
 
585 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  39.36 
 
 
585 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  40.97 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  40.97 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  40.97 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  40.97 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>