More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1801 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  100 
 
 		 475 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  49.58 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  49.58 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  51.46 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  50.62 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  45.95 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  43.97 
 
 		 465 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  46.85 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  42 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  43.72 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  45.68 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.78 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  42.4 
 
 		 582 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.38 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 578 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  43.34 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 584 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  41.81 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.9 
 
 		 582 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.46 
 
 		 600 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.11 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.67 
 
 		 494 aa  329  8e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.64 
 
 		 592 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.64 
 
 		 592 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  43.97 
 
 		 479 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.81 
 
 		 594 aa  326  5e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 587 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.04 
 
 		 590 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.63 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.51 
 
 		 588 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  38.94 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  42.13 
 
 		 589 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 590 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.6 
 
 		 476 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 479 aa  323  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 480 aa  322  9.000000000000001e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 587 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  41.05 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  40.74 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 585 aa  319  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  40.52 
 
 		 596 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  42.34 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  39.74 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.89 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  39.36 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.19 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  39.43 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  40.31 
 
 		 596 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 478 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  40.82 
 
 		 479 aa  316  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0136  hypothetical protein  42.8 
 
 		 474 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  40.75 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  42.04 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  42.04 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  41.82 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  41.03 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  41.03 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  41.7 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  41.03 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0151  hypothetical protein  42.58 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  38.81 
 
 		 585 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.83 
 
 		 474 aa  313  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  42.8 
 
 		 474 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  41.32 
 
 		 480 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  42.74 
 
 		 564 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  38.98 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  40.82 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  38.98 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.29 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  39.16 
 
 		 585 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  41.12 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.34 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>