More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0527 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  100 
 
 
499 aa  1008    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  59.45 
 
 
477 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  55.51 
 
 
477 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  49.06 
 
 
477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  46.62 
 
 
481 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  45.71 
 
 
473 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  45.59 
 
 
485 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  45.17 
 
 
473 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  48.3 
 
 
477 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  45.68 
 
 
474 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  45.68 
 
 
475 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  46.82 
 
 
485 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  42.12 
 
 
477 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  43.79 
 
 
465 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.65 
 
 
585 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  42.47 
 
 
471 aa  360  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.36 
 
 
584 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.39 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  42.41 
 
 
578 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.01 
 
 
585 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.17 
 
 
585 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  352  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.07 
 
 
582 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.59 
 
 
585 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.59 
 
 
585 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.04 
 
 
587 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.62 
 
 
583 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  41.44 
 
 
479 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  42.06 
 
 
601 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  41.34 
 
 
582 aa  349  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.49 
 
 
580 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.11 
 
 
594 aa  347  4e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.26 
 
 
592 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.26 
 
 
592 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.19 
 
 
586 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.72 
 
 
583 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.56 
 
 
588 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  38.82 
 
 
580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  40.12 
 
 
585 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  41.84 
 
 
577 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  42.23 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.26 
 
 
600 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41.6 
 
 
596 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.01 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.53 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  39.33 
 
 
581 aa  336  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  39.75 
 
 
466 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.86 
 
 
589 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  40.76 
 
 
482 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  39.54 
 
 
466 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  38.16 
 
 
478 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.53 
 
 
494 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1054  pyruvate kinase  41.68 
 
 
471 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157797  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  38.97 
 
 
580 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.5 
 
 
590 aa  329  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  39.96 
 
 
585 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  39.75 
 
 
585 aa  329  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  39.96 
 
 
585 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  41.51 
 
 
474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  41.75 
 
 
474 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  41.15 
 
 
478 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  40.5 
 
 
597 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.51 
 
 
476 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  40.21 
 
 
596 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.92 
 
 
483 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.79 
 
 
596 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.24 
 
 
485 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  38.87 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  38.11 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  41.6 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  41.18 
 
 
479 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  41.82 
 
 
472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  40.62 
 
 
470 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.25 
 
 
590 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  39.57 
 
 
470 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  41.59 
 
 
479 aa  318  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  38.74 
 
 
587 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  38.05 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  40.42 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.09 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  40.54 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  40.54 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  40.54 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  40.54 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  40.54 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  39.79 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  39.25 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  40.5 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  39.83 
 
 
605 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  39.87 
 
 
482 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  42.3 
 
 
509 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  39.92 
 
 
470 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  39.92 
 
 
470 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  39.92 
 
 
470 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>