More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1642 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  100 
 
 		 485 aa  981    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  57.51 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  56.45 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  59.21 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  56.11 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  52.97 
 
 		 485 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  50.62 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  50.62 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  40.83 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  46.82 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  41.21 
 
 		 477 aa  359  8e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  45.79 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  45.63 
 
 		 582 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  44.8 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42.99 
 
 		 584 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.57 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.71 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 482 aa  330  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  44.55 
 
 		 478 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.99 
 
 		 585 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.94 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.79 
 
 		 479 aa  326  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  40.9 
 
 		 476 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  43.38 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  40.91 
 
 		 583 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  41.27 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.2 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.33 
 
 		 580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  42.09 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  38.94 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 474 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  38.94 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  42.79 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  40.56 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  37.8 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  39.08 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  42.52 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.3 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  39.22 
 
 		 594 aa  313  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  39.78 
 
 		 596 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  39.54 
 
 		 596 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 600 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  40.45 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  39.5 
 
 		 470 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.31 
 
 		 596 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  44.24 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  44.68 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  38.99 
 
 		 597 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 588 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  38.77 
 
 		 482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  42.28 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.48 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  37.58 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  39.02 
 
 		 582 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.07 
 
 		 585 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  39.08 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  39.52 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 585 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  39.6 
 
 		 491 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  39.92 
 
 		 481 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  39.57 
 
 		 590 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  37.66 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 585 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  42.21 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 585 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 585 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.39 
 
 		 585 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  39.41 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  38.59 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>