More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0175 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  100 
 
 		 477 aa  970    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  58.61 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  55.51 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  53.28 
 
 		 477 aa  500  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  47.59 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  46.88 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  47.8 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  47.71 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  44.75 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  45.82 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  45.73 
 
 		 582 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  43.64 
 
 		 583 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  43.91 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  42.62 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.92 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  43.92 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  41.28 
 
 		 582 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.95 
 
 		 592 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.95 
 
 		 592 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  43.34 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 580 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  42.55 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  43.13 
 
 		 596 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 594 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 596 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  42.95 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 577 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  42.28 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  40.43 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.91 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  41.34 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  40.71 
 
 		 582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 578 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 590 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.25 
 
 		 590 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.1 
 
 		 600 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  42 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  40.83 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  40.88 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.68 
 
 		 476 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.62 
 
 		 485 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  41.53 
 
 		 585 aa  352  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  39.28 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  39.28 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  39.28 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 476 aa  349  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  41.1 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40.99 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 605 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  39.67 
 
 		 482 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  38.85 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 470 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  38.38 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  43.36 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.37 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.65 
 
 		 476 aa  342  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  40.76 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1054  pyruvate kinase  42.59 
 
 		 471 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157797  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  39.25 
 
 		 474 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  42.56 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 472 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 585 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  41.49 
 
 		 480 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 580 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>