More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4085 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  100 
 
 
485 aa  994    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  58.65 
 
 
473 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  57.02 
 
 
481 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  55.81 
 
 
473 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  55.46 
 
 
477 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  52.97 
 
 
485 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  44.75 
 
 
477 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  46.5 
 
 
475 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  45.95 
 
 
474 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  43.99 
 
 
465 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  48.82 
 
 
479 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  45.59 
 
 
499 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  47.11 
 
 
477 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  47.63 
 
 
478 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  44.78 
 
 
583 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  47.42 
 
 
585 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  43.76 
 
 
477 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  41.54 
 
 
477 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.1 
 
 
578 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.19 
 
 
474 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.88 
 
 
480 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  45.37 
 
 
584 aa  360  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.68 
 
 
583 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  46.62 
 
 
582 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  44.1 
 
 
590 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  44.55 
 
 
590 aa  352  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  44.16 
 
 
483 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  43.92 
 
 
480 aa  350  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  46.45 
 
 
471 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  44.58 
 
 
474 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  40.72 
 
 
476 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  42.69 
 
 
596 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  44.34 
 
 
601 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  44.39 
 
 
481 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  42.45 
 
 
596 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  44.37 
 
 
589 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  44.89 
 
 
577 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  42.69 
 
 
597 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.52 
 
 
481 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.87 
 
 
480 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44 
 
 
494 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.05 
 
 
585 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.79 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  40.25 
 
 
477 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  43.41 
 
 
580 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  42.21 
 
 
474 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  44.26 
 
 
472 aa  343  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  39.95 
 
 
583 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  41.89 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  41.74 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  41.73 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  43.06 
 
 
580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.76 
 
 
596 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  41.23 
 
 
472 aa  340  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  42.66 
 
 
587 aa  339  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.52 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  40.7 
 
 
580 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  41.42 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  45.43 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  39.79 
 
 
487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  42.35 
 
 
580 aa  336  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.52 
 
 
592 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.52 
 
 
592 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.59 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  44.34 
 
 
474 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.6 
 
 
588 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  44.84 
 
 
587 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  37.89 
 
 
582 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  41.36 
 
 
485 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  42.58 
 
 
479 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  43.4 
 
 
467 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  43.16 
 
 
467 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  44.19 
 
 
480 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  43.28 
 
 
491 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  43.5 
 
 
585 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  43.57 
 
 
605 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  43.54 
 
 
505 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.29 
 
 
585 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.58 
 
 
586 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  41.89 
 
 
480 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  43.16 
 
 
585 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  39.45 
 
 
474 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.92 
 
 
585 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1054  pyruvate kinase  46.79 
 
 
471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157797  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.92 
 
 
585 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  42.62 
 
 
476 aa  329  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  42.31 
 
 
472 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.52 
 
 
600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  40.17 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  41.93 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  40.17 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  40.17 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  39.87 
 
 
477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.33 
 
 
581 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>