More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0562 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  63.81 
 
 
588 aa  710    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  63.51 
 
 
585 aa  697    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0562  pyruvate kinase  100 
 
 
585 aa  1140    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2510  pyruvate kinase  66.15 
 
 
581 aa  739    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.812521 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1475  pyruvate kinase  58.2 
 
 
582 aa  642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.05 
 
 
584 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  40.55 
 
 
585 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  39.5 
 
 
583 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  42.22 
 
 
586 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  40.89 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  40.31 
 
 
583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  38.94 
 
 
580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  40.41 
 
 
580 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  40.88 
 
 
583 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  40.61 
 
 
585 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  38.77 
 
 
581 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  40.2 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  40.2 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  40.44 
 
 
585 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  40.72 
 
 
588 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  39.86 
 
 
578 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  40.44 
 
 
582 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  39.93 
 
 
585 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  41.3 
 
 
587 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  41.13 
 
 
582 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  38.88 
 
 
585 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  38.88 
 
 
585 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  38.36 
 
 
585 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  38.59 
 
 
600 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  40.14 
 
 
577 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  39.36 
 
 
585 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  38.41 
 
 
590 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  37.65 
 
 
580 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  38.12 
 
 
594 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  37.71 
 
 
601 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  38.44 
 
 
590 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  39.08 
 
 
582 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  37.48 
 
 
592 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  37.48 
 
 
592 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  38.33 
 
 
589 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  37.19 
 
 
587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  43.13 
 
 
476 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  40.17 
 
 
474 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.51 
 
 
476 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  44.21 
 
 
474 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  39.75 
 
 
474 aa  350  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  43.74 
 
 
474 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  42.71 
 
 
467 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  42.71 
 
 
467 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  43.04 
 
 
476 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  46 
 
 
490 aa  346  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  43.13 
 
 
472 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40 
 
 
472 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  44.23 
 
 
483 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  40.59 
 
 
472 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  36.29 
 
 
589 aa  343  7e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  42.71 
 
 
472 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  36.93 
 
 
605 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  39.07 
 
 
478 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  39.59 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  45.32 
 
 
474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  42.5 
 
 
487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  37.07 
 
 
596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  42.3 
 
 
493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  42.5 
 
 
474 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  43.95 
 
 
482 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  42 
 
 
481 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  43.31 
 
 
482 aa  333  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  43.67 
 
 
478 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  36.12 
 
 
580 aa  333  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  43.58 
 
 
480 aa  333  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  41.93 
 
 
480 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  42 
 
 
476 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.25 
 
 
471 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  42.28 
 
 
471 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.77 
 
 
476 aa  332  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  42.03 
 
 
479 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  41.79 
 
 
481 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  35.97 
 
 
596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  35.97 
 
 
596 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  43.28 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  36.16 
 
 
597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  42.41 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  41.14 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  42.89 
 
 
472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  42.28 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  41.23 
 
 
480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.87 
 
 
485 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  41.77 
 
 
472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  39.62 
 
 
488 aa  327  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  38.48 
 
 
471 aa  326  7e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  40.62 
 
 
470 aa  326  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  40.62 
 
 
470 aa  326  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  40.62 
 
 
470 aa  326  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  40.62 
 
 
470 aa  326  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>