More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3917 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3917  pyruvate kinase  100 
 
 
626 aa  1291    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3252  pyruvate kinase  61.39 
 
 
626 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0383  pyruvate kinase  45.66 
 
 
615 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0146444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0392  pyruvate kinase  45.66 
 
 
615 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3178  pyruvate kinase  44.53 
 
 
632 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0371  pyruvate kinase  45.26 
 
 
615 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339811  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0262  pyruvate kinase  46.09 
 
 
621 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0632  pyruvate kinase  44.66 
 
 
622 aa  452  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.830733  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15310  pyruvate kinase  43.21 
 
 
601 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0375407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0749  pyruvate kinase  40.69 
 
 
617 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0897  pyruvate kinase  40.69 
 
 
624 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3098  pyruvate kinase  34.21 
 
 
659 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1376  pyruvate kinase  51.2 
 
 
522 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2513  pyruvate kinase  48.57 
 
 
492 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3169  pyruvate kinase  44.7 
 
 
492 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2956  pyruvate kinase  48.02 
 
 
502 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2327  pyruvate kinase  48.62 
 
 
492 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150896  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5923  pyruvate kinase  46.03 
 
 
502 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1848  pyruvate kinase  44.72 
 
 
508 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0497  pyruvate kinase  44.31 
 
 
508 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.57458  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  30.28 
 
 
580 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  32.66 
 
 
488 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  32.78 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  33.47 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  32.78 
 
 
472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2510  pyruvate kinase  32.55 
 
 
581 aa  127  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.812521 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  30.82 
 
 
596 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0562  pyruvate kinase  34.13 
 
 
585 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  32.93 
 
 
483 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  32.38 
 
 
476 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  32.38 
 
 
582 aa  125  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  32.4 
 
 
480 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  35.08 
 
 
477 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  30.11 
 
 
596 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  32.92 
 
 
578 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  30.11 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  36.1 
 
 
474 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  30.28 
 
 
585 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  35.27 
 
 
491 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  29.75 
 
 
480 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  28.88 
 
 
485 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  30.52 
 
 
474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  32.83 
 
 
588 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  31.02 
 
 
479 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  30.11 
 
 
596 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  31.69 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  30.79 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  35.27 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  31.79 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  31.69 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  33.19 
 
 
586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  35.27 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1561  pyruvate kinase  33.6 
 
 
478 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  34.85 
 
 
489 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  29.39 
 
 
485 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  33.48 
 
 
486 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  32.98 
 
 
481 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  29.79 
 
 
600 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  29.64 
 
 
585 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  29.07 
 
 
485 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  31.71 
 
 
494 aa  117  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  33.61 
 
 
581 aa  117  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  27.37 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  27.25 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  29.24 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1475  pyruvate kinase  33.61 
 
 
582 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  33.05 
 
 
587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  28.05 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  31.05 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  31.56 
 
 
473 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  33.19 
 
 
461 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  29.78 
 
 
478 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  36.59 
 
 
569 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  31.37 
 
 
496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  27.68 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  28.44 
 
 
588 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  32.47 
 
 
590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  30.25 
 
 
594 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  30.92 
 
 
605 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  31.71 
 
 
473 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  33.91 
 
 
481 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  29.69 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  29.49 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0990  pyruvate kinase  31.43 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00681712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  28.9 
 
 
583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  30.52 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  33.06 
 
 
474 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  31.76 
 
 
471 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  33.18 
 
 
592 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  30.92 
 
 
476 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  28.92 
 
 
477 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  33.18 
 
 
592 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  35.17 
 
 
472 aa  111  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  29.86 
 
 
482 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  31.8 
 
 
467 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  31.8 
 
 
467 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  30.07 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  27.52 
 
 
478 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  29.72 
 
 
476 aa  110  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  30.88 
 
 
476 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>