More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0262 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0371  pyruvate kinase  63.65 
 
 
615 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339811  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0262  pyruvate kinase  100 
 
 
621 aa  1223    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674284  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0383  pyruvate kinase  63.48 
 
 
615 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0146444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0392  pyruvate kinase  63.48 
 
 
615 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0632  pyruvate kinase  67.36 
 
 
622 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.830733  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15310  pyruvate kinase  50.83 
 
 
601 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0375407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3252  pyruvate kinase  45.91 
 
 
626 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3917  pyruvate kinase  44.44 
 
 
626 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3178  pyruvate kinase  45.45 
 
 
632 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0749  pyruvate kinase  44.48 
 
 
617 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0897  pyruvate kinase  44.48 
 
 
624 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3098  pyruvate kinase  34.59 
 
 
659 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1376  pyruvate kinase  52.34 
 
 
522 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615881  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2327  pyruvate kinase  53.97 
 
 
492 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3169  pyruvate kinase  53.97 
 
 
492 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2513  pyruvate kinase  54.76 
 
 
492 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5923  pyruvate kinase  48.38 
 
 
502 aa  247  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2956  pyruvate kinase  52.78 
 
 
502 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0497  pyruvate kinase  47.29 
 
 
508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.57458  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1848  pyruvate kinase  46.93 
 
 
508 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  36.5 
 
 
473 aa  130  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  37.02 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  36.47 
 
 
488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  39.75 
 
 
472 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  35.74 
 
 
475 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  36.74 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  37.19 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  32.58 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  36.36 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1566  pyruvate kinase  32.22 
 
 
480 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  34.96 
 
 
487 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0441  pyruvate kinase  31.58 
 
 
480 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  36.87 
 
 
475 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0479  pyruvate kinase  32.79 
 
 
483 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3335  pyruvate kinase  30.08 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3136  pyruvate kinase  28.67 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.188208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3382  pyruvate kinase  28.67 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  38.71 
 
 
472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  35.34 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3357  pyruvate kinase  28.67 
 
 
359 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  33.6 
 
 
488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0415  pyruvate kinase  32.28 
 
 
480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0248117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  31.06 
 
 
476 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  38.08 
 
 
470 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  38.08 
 
 
470 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  36.47 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  34.42 
 
 
479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1896  pyruvate kinase  30.08 
 
 
352 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  38.89 
 
 
489 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  32.81 
 
 
482 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  38.89 
 
 
489 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  33.83 
 
 
472 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  39.35 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  32.03 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3123  pyruvate kinase  27.18 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  33.46 
 
 
476 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  35.74 
 
 
581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  36.88 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  33.45 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  35.34 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22404  pyruvate kinase 1  37.84 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.529919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3360  pyruvate kinase  28.32 
 
 
352 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100126  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  38.24 
 
 
481 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  35.77 
 
 
483 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  38.36 
 
 
474 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  37.55 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  37.24 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  32.35 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  31.96 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  31.97 
 
 
472 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  32.06 
 
 
585 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  33.02 
 
 
473 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  31.82 
 
 
472 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  32.93 
 
 
478 aa  114  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  35.71 
 
 
588 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  31.85 
 
 
477 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  33.91 
 
 
461 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3030  pyruvate kinase  31.09 
 
 
352 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1443  pyruvate kinase  35.06 
 
 
476 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  33.45 
 
 
485 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  36.95 
 
 
470 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  33.45 
 
 
475 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  35.88 
 
 
484 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  36.78 
 
 
483 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  33.92 
 
 
473 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  33.1 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  37.66 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  29.26 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  35.96 
 
 
478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  32.68 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  35.23 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  33.43 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  37.13 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  33.6 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  35 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  33.46 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  34.48 
 
 
583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  33.33 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  32.81 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  35.1 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>