More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0731 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  71.76 
 
 		 470 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  77.23 
 
 		 470 aa  713    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  100 
 
 		 469 aa  946    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  65.25 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  55.49 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  48.64 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.16 
 
 		 581 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  43.27 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 476 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  43.17 
 
 		 589 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.74 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  39.32 
 
 		 580 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.75 
 
 		 600 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  43.31 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  43.78 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  43.78 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.96 
 
 		 590 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.79 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  43.27 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  43.99 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.79 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  41.83 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  39.19 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  41.75 
 
 		 470 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 470 aa  319  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  42.42 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  42.32 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  40.88 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  42.55 
 
 		 580 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  40.3 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  42.31 
 
 		 587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  40.21 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  40.85 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.55 
 
 		 596 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 471 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  39.67 
 
 		 584 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  40.84 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  44.31 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  41.75 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  40 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  36.52 
 
 		 585 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 471 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  43.83 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 478 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.13 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  39.62 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  44.15 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  40.21 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  38.66 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  41.73 
 
 		 485 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  39.41 
 
 		 477 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  41.14 
 
 		 478 aa  309  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.73 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  41.28 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 483 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  38.92 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 583 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  41.55 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  39.12 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  39.41 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  37.84 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  39.22 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  40.8 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.06 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  41.83 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  39.41 
 
 		 484 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  40.87 
 
 		 488 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  38.09 
 
 		 474 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  39.34 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  39.7 
 
 		 478 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  37.71 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  40.52 
 
 		 473 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 479 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 582 aa  302  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  38.91 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  44.18 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>