More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2125 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  100 
 
 		 478 aa  972    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 488 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  50 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  48.12 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  48.64 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  47.7 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  46.06 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  39.42 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  37.55 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  37.84 
 
 		 476 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 586 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  37.01 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  36.8 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  36.49 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  36.9 
 
 		 584 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  38.36 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  34.5 
 
 		 580 aa  292  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3274  pyruvate kinase  40.32 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  34.48 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  35.27 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  38.33 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  37.63 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  37.94 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  38.51 
 
 		 478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  36.02 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  37.82 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  34.45 
 
 		 583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  36.54 
 
 		 601 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  37.34 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  37.34 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  37.89 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  36.64 
 
 		 590 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  37.67 
 
 		 594 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  36.25 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 475 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  37.88 
 
 		 589 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  34.09 
 
 		 583 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  36.63 
 
 		 480 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  38.11 
 
 		 587 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  35.82 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  34.43 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  38.41 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  35.71 
 
 		 596 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  35.62 
 
 		 582 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  35.71 
 
 		 596 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  35.71 
 
 		 597 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  35.88 
 
 		 577 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  33.69 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  34.3 
 
 		 583 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  37.94 
 
 		 592 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  37.94 
 
 		 592 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  38.17 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  36.59 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  35.06 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  38.17 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0205  pyruvate kinase  36.33 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  35.21 
 
 		 589 aa  276  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  36.48 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  37.63 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  35.97 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  36.7 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  37.3 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  36.27 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  38.17 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  36.42 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  34.92 
 
 		 585 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  37.63 
 
 		 470 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  35.98 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  37.27 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  35.22 
 
 		 478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  31.72 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  36.93 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  34.41 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  33.88 
 
 		 585 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  35.28 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  36.04 
 
 		 476 aa  273  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  35.97 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  36.93 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  36.08 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  36.07 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  38.28 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  35.05 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  35.19 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  37.8 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  34.71 
 
 		 585 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  34.5 
 
 		 585 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>