More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1505 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  76.55 
 
 		 472 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  100 
 
 		 478 aa  965    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  71.55 
 
 		 478 aa  688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  74.2 
 
 		 472 aa  727    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  69.3 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  65.62 
 
 		 505 aa  621  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  63.35 
 
 		 489 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  63.37 
 
 		 487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  62.26 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  62.26 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  59.92 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  58.39 
 
 		 476 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  58.85 
 
 		 476 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  58.12 
 
 		 476 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  57.57 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  58.42 
 
 		 471 aa  535  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  58.51 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  58.09 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  57.78 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  57.42 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  57.57 
 
 		 482 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  58.26 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  56.99 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  57.87 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  57.98 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  57.54 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  55.88 
 
 		 493 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  58 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  57.54 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  57.54 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  57.63 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  55.91 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  55.91 
 
 		 472 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  55.84 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  55.21 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  54.87 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  55.3 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  55.34 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  46.2 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 584 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  43.86 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  46.09 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  45.99 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 590 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 478 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.47 
 
 		 589 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  45.96 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  47.03 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  47.78 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  45.59 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  47.36 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  47.36 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.86 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.82 
 
 		 582 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.43 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  45.34 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  43.52 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  45.92 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.09 
 
 		 600 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  43.95 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  43.12 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.22 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  44.16 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.17 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  44.54 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  43.64 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  46.43 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  39.62 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 592 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 467 aa  362  9e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 592 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  41.7 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  40.34 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  45.55 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  45.74 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  42.53 
 
 		 487 aa  358  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  42.37 
 
 		 470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 587 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  41.72 
 
 		 585 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 596 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  42.68 
 
 		 484 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.42 
 
 		 590 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>