More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0607 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  86.88 
 
 		 480 aa  870    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  100 
 
 		 479 aa  982    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  56.16 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  55.3 
 
 		 478 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  55.02 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  55.02 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  54.09 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  55.09 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  53.22 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  53.77 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  53.97 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.86 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  54.72 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  51.65 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  52.07 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  50.52 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  52.24 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 495 aa  451  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  51.34 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  49.69 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  50.1 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  50 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  49.38 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  49.48 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  50 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  49.9 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  48.85 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  48.65 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  49.48 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  49.69 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  47.81 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  48.64 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  48.65 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.74 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  44.72 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.67 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  47.28 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  44.64 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.83 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45.22 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 583 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  47.12 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  47.1 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  41.79 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  40.99 
 
 		 580 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  41.27 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.91 
 
 		 585 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  42.47 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.13 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 478 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.21 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  42.89 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.27 
 
 		 600 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  40.98 
 
 		 582 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  42.55 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 585 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.06 
 
 		 585 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.03 
 
 		 580 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.06 
 
 		 585 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  40 
 
 		 509 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  41 
 
 		 582 aa  342  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.06 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  42.72 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  40.74 
 
 		 594 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  42.96 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 587 aa  338  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.32 
 
 		 585 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  42.27 
 
 		 587 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  42.06 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.12 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 590 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.44 
 
 		 474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  41.2 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 592 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  41.21 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 592 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  41.68 
 
 		 467 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  42.3 
 
 		 489 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.59 
 
 		 596 aa  336  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.58 
 
 		 601 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  42.77 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  42.09 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  42.09 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>