More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0741 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  86.88 
 
 
479 aa  870    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  100 
 
 
480 aa  986    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  55.21 
 
 
478 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  53.67 
 
 
478 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  53.14 
 
 
496 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  53.67 
 
 
496 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  53.04 
 
 
472 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  53.85 
 
 
489 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  52.93 
 
 
472 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  53.22 
 
 
505 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  52.7 
 
 
477 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  50.93 
 
 
474 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  53.25 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.45 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  48.97 
 
 
476 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  50.1 
 
 
476 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  51.55 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  50.31 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  50.92 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  49.38 
 
 
476 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  48.96 
 
 
477 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  48.11 
 
 
481 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  48.32 
 
 
471 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  48.23 
 
 
474 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  48.85 
 
 
472 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  50 
 
 
472 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  50 
 
 
472 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  48.85 
 
 
482 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  50 
 
 
472 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  48.43 
 
 
482 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  48.23 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  48.02 
 
 
472 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  47.5 
 
 
474 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  48.95 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  47.18 
 
 
476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  47.06 
 
 
471 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  48.95 
 
 
470 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  47.16 
 
 
472 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  46.99 
 
 
472 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  44.7 
 
 
584 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  45.53 
 
 
583 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  44.3 
 
 
482 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  45.12 
 
 
478 aa  364  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  42.92 
 
 
582 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  43.24 
 
 
583 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.99 
 
 
474 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.15 
 
 
585 aa  362  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  47.08 
 
 
471 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  41.96 
 
 
509 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.45 
 
 
583 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  42.56 
 
 
578 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  45.78 
 
 
474 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  45.18 
 
 
479 aa  352  7e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  46.1 
 
 
471 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  41.89 
 
 
472 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  40.86 
 
 
580 aa  349  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.24 
 
 
585 aa  349  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  44.16 
 
 
478 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  41.82 
 
 
585 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.03 
 
 
479 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  42.95 
 
 
585 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  41.82 
 
 
585 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  43.1 
 
 
480 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  41.82 
 
 
585 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  41.53 
 
 
582 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  40.92 
 
 
582 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  41.39 
 
 
479 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.2 
 
 
600 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  41.61 
 
 
585 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  41.12 
 
 
488 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.2 
 
 
585 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.65 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.36 
 
 
594 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  42.77 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.03 
 
 
580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  42.57 
 
 
481 aa  336  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  43.48 
 
 
489 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  42.74 
 
 
491 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  41.75 
 
 
488 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.87 
 
 
587 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  43.06 
 
 
489 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  41.63 
 
 
474 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  43.06 
 
 
489 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  40.7 
 
 
470 aa  332  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  42.16 
 
 
481 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  40.25 
 
 
580 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41 
 
 
596 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  39.96 
 
 
590 aa  330  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.02 
 
 
480 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  42.48 
 
 
470 aa  329  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.79 
 
 
581 aa  328  9e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  41.63 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.25 
 
 
592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.25 
 
 
592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  41.08 
 
 
587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>