More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  100 
 
 
470 aa  934    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  60.13 
 
 
474 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  59.7 
 
 
476 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  59.28 
 
 
477 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  59.96 
 
 
496 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  60.17 
 
 
478 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  59.45 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  59.06 
 
 
471 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  58.21 
 
 
476 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  58.51 
 
 
505 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  56.5 
 
 
474 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  56.29 
 
 
476 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  59.78 
 
 
495 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  60.34 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  56.55 
 
 
493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  60.78 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  55.34 
 
 
478 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  58.46 
 
 
496 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  57.3 
 
 
482 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  57.73 
 
 
482 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  55.56 
 
 
472 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  59.62 
 
 
472 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  55.56 
 
 
472 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  55.56 
 
 
472 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  55.13 
 
 
472 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  58.12 
 
 
489 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  55.56 
 
 
472 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  54.7 
 
 
472 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  55.65 
 
 
474 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  54.16 
 
 
474 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  57.11 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  55.34 
 
 
472 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  53.73 
 
 
476 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  54.7 
 
 
472 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  54.27 
 
 
476 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  54.6 
 
 
472 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  53.07 
 
 
477 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  48.95 
 
 
480 aa  435  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  49.89 
 
 
479 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  50.53 
 
 
478 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  49.15 
 
 
471 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.43 
 
 
585 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  47.25 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  49.05 
 
 
479 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  49.57 
 
 
474 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  43.34 
 
 
583 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  49.04 
 
 
474 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  46.91 
 
 
509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.52 
 
 
583 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  45.65 
 
 
582 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  46.68 
 
 
478 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.71 
 
 
584 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.64 
 
 
580 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  44.04 
 
 
589 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  47.67 
 
 
471 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  48.84 
 
 
491 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  45.18 
 
 
594 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.15 
 
 
482 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  43.34 
 
 
582 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  43.71 
 
 
590 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  42.61 
 
 
578 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  42.59 
 
 
580 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  40.59 
 
 
580 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  44.59 
 
 
586 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.67 
 
 
480 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  42.37 
 
 
478 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.47 
 
 
587 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.5 
 
 
582 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  47.78 
 
 
489 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  43.76 
 
 
481 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  42.67 
 
 
470 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.72 
 
 
590 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  43.55 
 
 
481 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  45.17 
 
 
479 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  47.15 
 
 
489 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  45.55 
 
 
478 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  45.74 
 
 
492 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  46.09 
 
 
483 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  44.33 
 
 
592 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  44.33 
 
 
592 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  46.48 
 
 
479 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.77 
 
 
577 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  45.53 
 
 
492 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  46.93 
 
 
489 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  43.68 
 
 
477 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.46 
 
 
474 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.65 
 
 
476 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.09 
 
 
480 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  46.06 
 
 
474 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  43.25 
 
 
600 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  42.31 
 
 
476 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.51 
 
 
581 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  42.71 
 
 
587 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  43.04 
 
 
477 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  45.4 
 
 
470 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  45.13 
 
 
478 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  44.21 
 
 
488 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  43.68 
 
 
480 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.83 
 
 
596 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  41.19 
 
 
585 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>