More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1103 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  100 
 
 		 472 aa  958    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  63.64 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  65.25 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  62.37 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  53.04 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  48.74 
 
 		 488 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  46.06 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  43.71 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  40.67 
 
 		 476 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.26 
 
 		 594 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.21 
 
 		 581 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 589 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.85 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  41.08 
 
 		 601 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.72 
 
 		 600 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 590 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  42.04 
 
 		 470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  40.59 
 
 		 596 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.7 
 
 		 476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  40.28 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  40.8 
 
 		 596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 584 aa  320  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 479 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 597 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  40.43 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 592 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 592 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  38.72 
 
 		 580 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 483 aa  316  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.77 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  39.46 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  36.44 
 
 		 585 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  41.35 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  41.35 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  41.4 
 
 		 483 aa  312  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  41.19 
 
 		 471 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  42.13 
 
 		 475 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  41.77 
 
 		 470 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  39.28 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  43.11 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  42.92 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 580 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  37.95 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  38.46 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  38.77 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  40.21 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  44.01 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  44.89 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  43.79 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  43.09 
 
 		 474 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  42.11 
 
 		 472 aa  306  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  40.87 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  39.49 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  40.67 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  42.69 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  40.12 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  39.16 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  43.12 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  38.24 
 
 		 578 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  40.46 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  39.83 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  43.19 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  39.03 
 
 		 585 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  39.16 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  40.46 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  35.73 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0655  pyruvate kinase  44.31 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 478 aa  299  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  37.13 
 
 		 583 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  38.66 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  38.78 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  38.99 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.37 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3274  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  38.9 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  36.42 
 
 		 583 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  37.05 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  38.45 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  38.95 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  39.09 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  38.45 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>