More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3014 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  100 
 
 		 488 aa  1011    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  59.7 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 478 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  49.47 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  48.74 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  38.96 
 
 		 581 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 594 aa  330  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  38.67 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  39.04 
 
 		 596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.33 
 
 		 596 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  38.33 
 
 		 597 aa  316  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.33 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  38 
 
 		 596 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  38.83 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40.28 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  38.73 
 
 		 592 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  38.73 
 
 		 592 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  37.84 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  37.84 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  38.77 
 
 		 485 aa  309  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.53 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  39.26 
 
 		 590 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  38.25 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  39.72 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  39.34 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  41.98 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  38.24 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  39.12 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  39.04 
 
 		 587 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  36.61 
 
 		 580 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  38.17 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  37.37 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  38.01 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  37.4 
 
 		 476 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  39.16 
 
 		 585 aa  299  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  37.82 
 
 		 474 aa  299  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  39.17 
 
 		 589 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  37.03 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  38.98 
 
 		 480 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  38.39 
 
 		 580 aa  296  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  39.48 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  37.58 
 
 		 600 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  41.51 
 
 		 483 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  36.27 
 
 		 583 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  37.34 
 
 		 577 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  36.29 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  38.55 
 
 		 588 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  37.83 
 
 		 590 aa  290  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  37 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  34.72 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  40.33 
 
 		 470 aa  287  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  38.59 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  38.59 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  37.14 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  37.89 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  38.92 
 
 		 472 aa  286  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  37.26 
 
 		 478 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  39.09 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  38.28 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  35.55 
 
 		 582 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  35.94 
 
 		 496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  38.06 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  36.97 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  35.95 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  36.55 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  36.9 
 
 		 481 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  37.39 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3274  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 487 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  36.04 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  34.99 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  38.13 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  37.78 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  38.41 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  34.72 
 
 		 585 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  35.59 
 
 		 578 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  37.83 
 
 		 476 aa  280  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  36.69 
 
 		 475 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  40.14 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  40.14 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  35.82 
 
 		 479 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  34.85 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  40.14 
 
 		 471 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  40.14 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  37 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  37.55 
 
 		 474 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  35.94 
 
 		 477 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  39.02 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>