More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2252 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  974    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  59.7 
 
 		 488 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  55.37 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  55.49 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  50 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  53.47 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  53.04 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  40.43 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  40.22 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 581 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  40.48 
 
 		 594 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  38.16 
 
 		 584 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  40.13 
 
 		 478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 476 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 477 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  39.03 
 
 		 476 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  41.54 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  39.2 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 590 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 592 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 592 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  38.87 
 
 		 601 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  39.5 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  38.3 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  39.91 
 
 		 472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  38.65 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  39.62 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  38.7 
 
 		 596 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 477 aa  305  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  39.83 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  40.71 
 
 		 494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  38.7 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  38.58 
 
 		 597 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  39.48 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  38.15 
 
 		 596 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  36.61 
 
 		 590 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.15 
 
 		 596 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  38.82 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  36.02 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  38.2 
 
 		 582 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  36.33 
 
 		 583 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  38.99 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  41.25 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  37.2 
 
 		 485 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 472 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  37.55 
 
 		 587 aa  299  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  39.53 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  39.21 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  36.15 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  40.67 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 478 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 484 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  35.9 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  38.56 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  36.44 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  38.94 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 600 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  35.68 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  40.86 
 
 		 605 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  38.56 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  39.28 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  40.04 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  37.73 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 474 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  39.12 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  40.29 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  35.57 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  39.25 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  39.12 
 
 		 582 aa  292  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  38.54 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  38.98 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  38.87 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  36.29 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0479  pyruvate kinase  35.91 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  36.97 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  36.53 
 
 		 577 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  39.35 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2104  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1446  pyruvate kinase  42.23 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  36.75 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  35.76 
 
 		 476 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  38.12 
 
 		 585 aa  289  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>