More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0965 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  70.91 
 
 		 470 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  100 
 
 		 470 aa  943    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  77.23 
 
 		 469 aa  713    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  63.64 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2252  pyruvate kinase  55.37 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.738667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3014  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 488 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  48.12 
 
 		 478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  41.53 
 
 		 581 aa  351  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  42.16 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  43.78 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  41.82 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  41.76 
 
 		 589 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  42.58 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  39.42 
 
 		 584 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.96 
 
 		 600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 592 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 592 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.96 
 
 		 601 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  43.61 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.92 
 
 		 590 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.05 
 
 		 478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 476 aa  320  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  41.84 
 
 		 476 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  39.45 
 
 		 470 aa  319  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  38.82 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.21 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  37.08 
 
 		 585 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.19 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  44.17 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  41.49 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  41.51 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  41.63 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  37.47 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  42.42 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  42.05 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 480 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  38.98 
 
 		 582 aa  306  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.4 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  38.99 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  40.2 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 580 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  37.61 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  37.26 
 
 		 583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  37.39 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 590 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  37.71 
 
 		 585 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.67 
 
 		 494 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 480 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  38.75 
 
 		 479 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  39.51 
 
 		 596 aa  303  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  42.21 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  38.1 
 
 		 470 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  38.36 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  38.52 
 
 		 481 aa  302  9e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 471 aa  302  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 588 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.51 
 
 		 596 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  39.21 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  38.12 
 
 		 585 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.44 
 
 		 596 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  39.12 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  299  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  40.64 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  39.5 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  37.92 
 
 		 585 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  41.13 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 587 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  37.08 
 
 		 467 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  39.5 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  37.71 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  37.71 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.02 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  38.77 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>