More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0205 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0572  pyruvate kinase  71.37 
 
 		 479 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  71.25 
 
 		 478 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0558  pyruvate kinase  72.63 
 
 		 478 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5958  pyruvate kinase  71.31 
 
 		 478 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0360  pyruvate kinase  75.84 
 
 		 476 aa  716    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0671  pyruvate kinase  71.73 
 
 		 478 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  71.88 
 
 		 564 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0930  pyruvate kinase  83.12 
 
 		 478 aa  804    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0205  pyruvate kinase  100 
 
 		 476 aa  971    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4634  pyruvate kinase  82.98 
 
 		 477 aa  797    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  71.25 
 
 		 478 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0502  pyruvate kinase  72.84 
 
 		 479 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  81.89 
 
 		 482 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2016  pyruvate kinase  71.52 
 
 		 478 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0460  pyruvate kinase  70.82 
 
 		 478 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31073  normal  0.427557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0290  pyruvate kinase  78.22 
 
 		 478 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2656  pyruvate kinase  71.52 
 
 		 478 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2674  pyruvate kinase  71.52 
 
 		 478 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0479  pyruvate kinase  72.63 
 
 		 479 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2627  pyruvate kinase  71.52 
 
 		 478 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3305  pyruvate kinase  81.68 
 
 		 478 aa  790    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0492  pyruvate kinase  72.84 
 
 		 479 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4581  pyruvate kinase  81.61 
 
 		 478 aa  782    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3873  pyruvate kinase  82.56 
 
 		 477 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3956  pyruvate kinase  81.47 
 
 		 478 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  71.67 
 
 		 478 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0196  pyruvate kinase  82.18 
 
 		 496 aa  764    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2547  pyruvate kinase  71.31 
 
 		 478 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138922  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1490  pyruvate kinase  64.48 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1816  pyruvate kinase  62.34 
 
 		 478 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0923913  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1531  pyruvate kinase  63.31 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  63.21 
 
 		 477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0162  pyruvate kinase  59.62 
 
 		 477 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.158793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  57.65 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0385  pyruvate kinase  56.3 
 
 		 484 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2850  pyruvate kinase  55.91 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3249  pyruvate kinase II  55.91 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  54.85 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  55.11 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2805  pyruvate kinase  54.53 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  54.17 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2387  pyruvate kinase  54.43 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0280741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0968  pyruvate kinase  52.4 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01242  pyruvate kinase II  51.66 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.01193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  53.75 
 
 		 489 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1040  pyruvate kinase  51.57 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  50.1 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  51.57 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1594  pyruvate kinase II  51.77 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0247  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000162471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1830  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  51.45 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  51.24 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  51.45 
 
 		 484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1078  pyruvate kinase  51.56 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346201  hitchhiker  0.000000814857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  51.24 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2114  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2770  pyruvate kinase  51.78 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00459379  hitchhiker  0.00854909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1831  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4029  pyruvate kinase  51.56 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27240  Pyruvate kinase  52.72 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51360  Pyruvate kinase  52.61 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1308  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0579  pyruvate kinase II  51.26 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  51.46 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22190  Pyruvate kinase  52.61 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  51.05 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2024  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0139067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43370  Pyruvate kinase  52.4 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.692487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4337  pyruvate kinase  51.14 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3622  pyruvate kinase  51.15 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2136  pyruvate kinase  51.67 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02874  pyruvate kinase II  50.32 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2081  pyruvate kinase  50.62 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2048  pyruvate kinase  50.83 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.802342  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1927  pyruvate kinase  50.83 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315658  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2361  pyruvate kinase  52.51 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.011501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38410  pyruvate kinase  50.73 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49990  Pyruvate kinase  52.4 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1864  pyruvate kinase  50.83 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2414  pyruvate kinase  51.46 
 
 		 480 aa  445  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000465691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1360  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2047  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.203446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1236  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2042  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1849  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2084  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00593722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2423  pyruvate kinase  50.84 
 
 		 480 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0231497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2102  pyruvate kinase  51.26 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.590561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1890  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2153  pyruvate kinase  50.41 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39397  normal  0.789871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1814  pyruvate kinase  50.31 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000221923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>