263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1095 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  68.65 
 
 		 699 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  72.54 
 
 		 701 aa  1044    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.91 
 
 		 777 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  68.73 
 
 		 704 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  79.54 
 
 		 760 aa  1182    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  75.42 
 
 		 727 aa  1120    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.86 
 
 		 697 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.09 
 
 		 741 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  59.3 
 
 		 737 aa  765    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  50.9 
 
 		 758 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  57.09 
 
 		 764 aa  795    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.78 
 
 		 701 aa  899    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 760 aa  1518    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.2 
 
 		 739 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.14 
 
 		 733 aa  905    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  77.55 
 
 		 728 aa  1148    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  64.91 
 
 		 726 aa  867    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  87.23 
 
 		 822 aa  909    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  74.71 
 
 		 764 aa  1075    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.34 
 
 		 789 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  69.16 
 
 		 696 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.79 
 
 		 704 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.04 
 
 		 777 aa  802    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  49.41 
 
 		 738 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.92 
 
 		 727 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  49.55 
 
 		 720 aa  686    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.19 
 
 		 764 aa  789    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.75 
 
 		 721 aa  794    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.99 
 
 		 697 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.39 
 
 		 724 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.46 
 
 		 728 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  67.05 
 
 		 821 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.74 
 
 		 740 aa  728    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  46.4 
 
 		 738 aa  599  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  44.85 
 
 		 721 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  46.87 
 
 		 723 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  46.72 
 
 		 677 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.9 
 
 		 687 aa  558  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  54.84 
 
 		 685 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.32 
 
 		 686 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  43.68 
 
 		 723 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.29 
 
 		 687 aa  416  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.56 
 
 		 687 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  35.82 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.77 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.97 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.16 
 
 		 690 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.51 
 
 		 684 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.61 
 
 		 697 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.42 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.56 
 
 		 696 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  33.98 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.94 
 
 		 687 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.61 
 
 		 697 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.01 
 
 		 684 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.38 
 
 		 684 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 		 685 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.38 
 
 		 684 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 683 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  35.14 
 
 		 700 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.84 
 
 		 705 aa  373  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 		 684 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.66 
 
 		 705 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.77 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.9 
 
 		 688 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.07 
 
 		 687 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.81 
 
 		 689 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.12 
 
 		 697 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.38 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.14 
 
 		 685 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.13 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 		 689 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.2 
 
 		 688 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.68 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  35.12 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.64 
 
 		 693 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.73 
 
 		 689 aa  369  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.46 
 
 		 696 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.69 
 
 		 697 aa  364  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.12 
 
 		 689 aa  364  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.08 
 
 		 693 aa  363  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.62 
 
 		 692 aa  362  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.06 
 
 		 684 aa  360  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0644  glycine--tRNA ligase  35.24 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.31 
 
 		 693 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 		 699 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.39 
 
 		 707 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 		 689 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.05 
 
 		 699 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.71 
 
 		 699 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.08 
 
 		 697 aa  355  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.81 
 
 		 696 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.87 
 
 		 704 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.72 
 
 		 689 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>