263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0155 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
705 aa  1443    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0004  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.83 
 
 
701 aa  597  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0024  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.6 
 
 
703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.700385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.24 
 
 
728 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
739 aa  412  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  34.54 
 
 
720 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.52 
 
 
741 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.89 
 
 
697 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.94 
 
 
701 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.89 
 
 
697 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  33.81 
 
 
685 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.01 
 
 
727 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.97 
 
 
728 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.52 
 
 
687 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.47 
 
 
740 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  33.01 
 
 
721 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0756  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.57 
 
 
696 aa  385  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  33.29 
 
 
738 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.71 
 
 
733 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  33.2 
 
 
758 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.11 
 
 
760 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.35 
 
 
777 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
764 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
727 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.35 
 
 
777 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.97 
 
 
760 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
701 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.97 
 
 
704 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  32.15 
 
 
723 aa  369  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.82 
 
 
724 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.32 
 
 
764 aa  364  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.54 
 
 
789 aa  360  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.11 
 
 
721 aa  359  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.76 
 
 
686 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.99 
 
 
699 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.82 
 
 
704 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.07 
 
 
764 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.47 
 
 
726 aa  357  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  30.55 
 
 
738 aa  352  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.43 
 
 
696 aa  351  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  31.87 
 
 
723 aa  350  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.93 
 
 
737 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.78 
 
 
694 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.06 
 
 
693 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  31.44 
 
 
677 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  30.4 
 
 
695 aa  323  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.67 
 
 
821 aa  323  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  28.91 
 
 
690 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.23 
 
 
696 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.54 
 
 
705 aa  316  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.77 
 
 
696 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.98 
 
 
822 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.75 
 
 
697 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.22 
 
 
688 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.93 
 
 
694 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.48 
 
 
698 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  28.45 
 
 
700 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.81 
 
 
690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.44 
 
 
689 aa  307  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.44 
 
 
692 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.54 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.59 
 
 
687 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  30.55 
 
 
688 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.14 
 
 
687 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  27.43 
 
 
696 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  30.89 
 
 
694 aa  300  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.25 
 
 
687 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  27.67 
 
 
693 aa  297  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.51 
 
 
688 aa  296  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 
687 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.27 
 
 
689 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  27.94 
 
 
691 aa  295  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.17 
 
 
686 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  28.83 
 
 
688 aa  294  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.49 
 
 
688 aa  293  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.62 
 
 
689 aa  293  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.87 
 
 
691 aa  292  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.98 
 
 
701 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  28.69 
 
 
694 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.44 
 
 
684 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.82 
 
 
692 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.87 
 
 
688 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.5 
 
 
683 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.27 
 
 
687 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.32 
 
 
684 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.84 
 
 
689 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.84 
 
 
689 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.26 
 
 
684 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.84 
 
 
689 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.71 
 
 
688 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.7 
 
 
689 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.27 
 
 
689 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.7 
 
 
689 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.16 
 
 
689 aa  289  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.85 
 
 
694 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.84 
 
 
689 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.93 
 
 
701 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.7 
 
 
689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.7 
 
 
689 aa  287  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.7 
 
 
689 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>