263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0024 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0004  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  79.94 
 
 
701 aa  1122    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0024  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
703 aa  1409    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.700385  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.6 
 
 
705 aa  594  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.15 
 
 
741 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0756  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.17 
 
 
696 aa  388  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.42 
 
 
739 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.7 
 
 
727 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  29.69 
 
 
720 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.87 
 
 
687 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.31 
 
 
728 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.22 
 
 
701 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.71 
 
 
728 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  29.28 
 
 
738 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  27.73 
 
 
685 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  29.5 
 
 
721 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.85 
 
 
697 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.57 
 
 
697 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.61 
 
 
727 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.88 
 
 
721 aa  349  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.77 
 
 
760 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.9 
 
 
724 aa  348  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.3 
 
 
764 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.13 
 
 
740 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.9 
 
 
726 aa  343  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.53 
 
 
704 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  27.92 
 
 
758 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.5 
 
 
760 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.73 
 
 
733 aa  339  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  29.23 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.52 
 
 
701 aa  337  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 
764 aa  336  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  27.32 
 
 
738 aa  331  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.72 
 
 
789 aa  328  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.23 
 
 
686 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.17 
 
 
777 aa  324  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  26.92 
 
 
723 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.25 
 
 
696 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.17 
 
 
777 aa  324  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.4 
 
 
704 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.91 
 
 
687 aa  317  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.92 
 
 
764 aa  316  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 
687 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.48 
 
 
737 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.17 
 
 
699 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.23 
 
 
688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  25.85 
 
 
700 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.37 
 
 
687 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.97 
 
 
697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.7 
 
 
687 aa  302  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  27.49 
 
 
677 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.86 
 
 
690 aa  300  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
822 aa  300  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.5 
 
 
686 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.09 
 
 
687 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
697 aa  297  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.95 
 
 
697 aa  296  9e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.12 
 
 
694 aa  293  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.65 
 
 
694 aa  293  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.31 
 
 
688 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  25.98 
 
 
695 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.1 
 
 
821 aa  290  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  24.96 
 
 
696 aa  290  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.02 
 
 
688 aa  287  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  27.73 
 
 
690 aa  287  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  25.39 
 
 
693 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.4 
 
 
689 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.35 
 
 
684 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.12 
 
 
689 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  283  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.26 
 
 
689 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.74 
 
 
688 aa  281  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.4 
 
 
690 aa  280  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.55 
 
 
679 aa  279  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  25.6 
 
 
688 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.54 
 
 
692 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.22 
 
 
689 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.27 
 
 
705 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.22 
 
 
689 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.22 
 
 
689 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.22 
 
 
689 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.92 
 
 
684 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.22 
 
 
689 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.18 
 
 
694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.18 
 
 
694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.35 
 
 
678 aa  273  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.99 
 
 
692 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  26.84 
 
 
694 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.67 
 
 
684 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.69 
 
 
693 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.28 
 
 
683 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  26.95 
 
 
693 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.32 
 
 
684 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.67 
 
 
683 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  25.07 
 
 
684 aa  268  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>