263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0644 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.37 
 
 		 821 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.29 
 
 		 760 aa  715    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.13 
 
 		 741 aa  674    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  100 
 
 		 758 aa  1538    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.32 
 
 		 777 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 		 728 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 		 727 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.39 
 
 		 726 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  82.06 
 
 		 697 aa  1177    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.44 
 
 		 777 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.34 
 
 		 697 aa  963    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.9 
 
 		 760 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  62.91 
 
 		 739 aa  927    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 		 728 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47 
 
 		 764 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.92 
 
 		 764 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.29 
 
 		 822 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.19 
 
 		 764 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  75.6 
 
 		 687 aa  764    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.87 
 
 		 789 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  50.06 
 
 		 738 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.07 
 
 		 733 aa  714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  66.23 
 
 		 720 aa  963    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.23 
 
 		 724 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  76.95 
 
 		 685 aa  759    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.63 
 
 		 727 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.64 
 
 		 740 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  46.68 
 
 		 721 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  44.4 
 
 		 738 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.92 
 
 		 701 aa  572  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  44.16 
 
 		 723 aa  552  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.11 
 
 		 701 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.01 
 
 		 704 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.86 
 
 		 704 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.8 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.65 
 
 		 699 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  44.14 
 
 		 677 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  52.93 
 
 		 721 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  45.28 
 
 		 723 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.4 
 
 		 737 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.01 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  35.65 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.81 
 
 		 694 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.12 
 
 		 687 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.24 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.46 
 
 		 693 aa  362  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.73 
 
 		 683 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.5 
 
 		 692 aa  353  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.5 
 
 		 689 aa  352  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0004  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.27 
 
 		 701 aa  350  5e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 687 aa  350  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.51 
 
 		 699 aa  349  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  31.72 
 
 		 695 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  32.33 
 
 		 691 aa  348  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.5 
 
 		 688 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.89 
 
 		 699 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.1 
 
 		 705 aa  343  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 		 687 aa  343  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.59 
 
 		 745 aa  340  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.15 
 
 		 683 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.85 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.86 
 
 		 693 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.52 
 
 		 693 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.25 
 
 		 689 aa  337  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.26 
 
 		 693 aa  336  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  33.04 
 
 		 729 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.62 
 
 		 686 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.53 
 
 		 687 aa  334  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.38 
 
 		 693 aa  334  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.77 
 
 		 697 aa  330  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.81 
 
 		 688 aa  330  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  39.13 
 
 		 688 aa  330  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  33.33 
 
 		 696 aa  328  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.84 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.33 
 
 		 690 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.36 
 
 		 692 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.97 
 
 		 710 aa  320  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.524717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.57 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0889  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.21 
 
 		 722 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 		 699 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.9 
 
 		 697 aa  317  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  38.87 
 
 		 696 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.29 
 
 		 722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.82 
 
 		 687 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.46 
 
 		 701 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 		 701 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.77 
 
 		 696 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.51 
 
 		 739 aa  314  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 		 701 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.61 
 
 		 689 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3982  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.46 
 
 		 691 aa  313  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.295232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.71 
 
 		 702 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>