More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0116 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.23 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.49 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.9 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.49 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.94 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.71 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.67 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.91 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.76 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.91 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.47 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.47 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.47 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.47 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.7 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.91 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.42 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.09 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.75 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  29.61 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.1 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.71 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  34.48 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  34.48 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  34.48 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.46 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  34.48 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  30.14 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.73 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.62 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.92 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  35.33 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>