70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2746 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  75.34 
 
 		 301 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  38.13 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  36.27 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  37.46 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  31.58 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  30.03 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  30 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0758  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1041  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2884  regulatory protein DeoR  33.14 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  30.41 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3434  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  30.41 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  30.41 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1387  regulatory protein DeoR  32.37 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  24.5 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.54 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  28.98 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.9 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  26.15 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0084  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.499568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3355  transcriptional regulator protein-like protein  48.21 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  27.17 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.27 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.21 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.36 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  27.44 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  24.74 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  28.45 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 1078 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  26.55 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.5 
 
 		 687 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.2 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.23 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29 
 
 		 164 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.13 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  26.74 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.53 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  26.15 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.03 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.55 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  27.47 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.67 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.54 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1071  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.82 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.045266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  28.67 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  23.98 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.06 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  26.72 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  24.52 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  24.39 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  24.52 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.9 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.83 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.18 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.41 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  24.52 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.26 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.91 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 369 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  34.09 
 
 		 904 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.9 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>