20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0952 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.84 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.5 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  25.5 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  22.8 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  26.16 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.53 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  23.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.02 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.39 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.34 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  24.88 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  30.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.21 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  22.01 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.18 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5442  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>