57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0597 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  97.08 
 
 		 290 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  50.63 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.43 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.58 
 
 		 301 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  26.78 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  29.29 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  30.84 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  24.38 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.53 
 
 		 327 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  24.1 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  25.87 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0758  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.31 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  30.86 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  22.04 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.84 
 
 		 334 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.93 
 
 		 687 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.58 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  26.8 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.8 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.6 
 
 		 337 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 322 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1071  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.37 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.045266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  25.4 
 
 		 326 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3434  transcriptional regulator  21.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3508  hypothetical protein  20.22 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.8 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.6 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.87 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1041  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.08 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.81 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1013  hypothetical protein  31.08 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.14 
 
 		 325 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.62 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.93 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2888  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.54 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.77 
 
 		 319 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.27 
 
 		 329 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.83 
 
 		 333 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  23.67 
 
 		 322 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  22.22 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 317 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 337 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.83 
 
 		 335 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.87 
 
 		 332 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  27.52 
 
 		 368 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.64 
 
 		 339 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>