37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0826 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  50.17 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.71 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  25.5 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  29.73 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.98 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  23.53 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  25.18 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.09 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  24.38 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  24 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  22.41 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  24.15 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  22.8 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  29.24 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.75 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.67 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.22 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  23.75 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  21.52 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  23.6 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.2 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  25.14 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.76 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.62 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  22.22 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  21.08 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  23.12 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  23.12 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  23.12 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>