34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0918 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  48.46 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  50.17 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  25 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.24 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  30.37 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  24.46 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  23.76 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  28.65 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  21.43 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.29 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.29 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  26.39 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.76 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.96 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.71 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.27 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  26.79 
 
 		 238 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.77 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  24.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.12 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.17 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3598  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  30 
 
 		 877 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.47 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  23.81 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  24.36 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  26.82 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.15 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.69 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.71 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.71 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>