39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0901 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  100 
 
 		 170 aa  346  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  70.59 
 
 		 170 aa  245  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  47.5 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  43.03 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  50.78 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  34.72 
 
 		 198 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  35 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  30.82 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  25.94 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  35.09 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  30.87 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  30.87 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  32.23 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  31.45 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  29.84 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  27.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  27.85 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  27.85 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  28.93 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  28.57 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  28.93 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  27.85 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  29.13 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  28.93 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  26.76 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  25.3 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  28.7 
 
 		 494 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  26.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  26.95 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  26.06 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  28.28 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  26.95 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  26.95 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  27.19 
 
 		 495 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>