14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0953 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  51.09 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  44.52 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  46.63 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  43.04 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  44.52 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  41.92 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  41.81 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  36.71 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  32.1 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  28.29 
 
 		 207 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  27.54 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  28.28 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>