21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1658 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  47.5 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  43.56 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  46.71 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  42 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  42 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  46.56 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  37.02 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  32.19 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  29.84 
 
 		 494 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  27.94 
 
 		 203 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  29.7 
 
 		 495 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  25.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  26.4 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  27.61 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  31.15 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  27.94 
 
 		 210 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  33.82 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  26.87 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>