26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4343 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  100 
 
 		 174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  50.67 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  46.11 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  45.78 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  46.81 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  42.35 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  42.95 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  31.87 
 
 		 198 aa  87.8  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  38.19 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  33.76 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  33.12 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  38.82 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  32.48 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  32.69 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  28.83 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  34.67 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  29.86 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  32.69 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  25.32 
 
 		 495 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  31.73 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  39.24 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  32.98 
 
 		 203 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  26.89 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>