29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0897 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  100 
 
 
171 aa  340  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  97.08 
 
 
171 aa  331  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  50.61 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  56.69 
 
 
182 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  44.44 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  42 
 
 
169 aa  120  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  41.36 
 
 
170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  41.22 
 
 
174 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  41.67 
 
 
198 aa  101  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  43.42 
 
 
174 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  35.56 
 
 
200 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  37.21 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  38.71 
 
 
495 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  32.14 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  34.41 
 
 
494 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  33.64 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  32.14 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  29.68 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  34.95 
 
 
200 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  30.93 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  29.91 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  30.93 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  28.12 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  27.16 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 
201 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 
206 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  28.21 
 
 
206 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>