90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2718 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  89.55 
 
 		 206 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  89 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  87.56 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  87.56 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  86.57 
 
 		 206 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  64.06 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  76.02 
 
 		 209 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  73.03 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  73.03 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  75.93 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  75.31 
 
 		 211 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  75.31 
 
 		 215 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  65.52 
 
 		 210 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  75.31 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  75.31 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  63.58 
 
 		 211 aa  227  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  45.28 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  44.72 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  44.72 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  43.9 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  43.17 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  37.63 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  30.48 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  30.1 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  32.52 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  31.9 
 
 		 495 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  30.15 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  34.07 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  28.11 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  30.6 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  26.71 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  27.92 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.27 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  29.1 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  32.95 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  29.07 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  28.36 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  28 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  27.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  28.98 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  22.8 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  27.92 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  27.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  24.71 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  24.71 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  30.71 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  30.63 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  33.82 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  27.38 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  28.57 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  28.04 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  27.18 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.18 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  28.42 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  25.37 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  28.3 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  23.88 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  28.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  24.38 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  27.08 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  22.6 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 219 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  28.71 
 
 		 208 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>