24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3231 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  48.98 
 
 		 198 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  37.02 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  38.98 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  40.58 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  41.23 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  32.73 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  37.7 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  29.12 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  30.87 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  30.82 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  32.68 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  36.36 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  32.74 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  29.2 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  29.01 
 
 		 247 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  28.22 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 		 200 aa  44.3  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  22.58 
 
 		 203 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  29.05 
 
 		 190 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>