85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0252 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  97.58 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  82.86 
 
 		 209 aa  347  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  51.53 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  49.17 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  45.89 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  46.11 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  47.56 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  47.56 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  47.56 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  46.34 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  45.73 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  45.73 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  45.73 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  47.56 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  45.12 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  46.95 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  37.63 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  31 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  28.8 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  28.57 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  34.34 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  34.17 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  28 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  32.81 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  28 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  27.8 
 
 		 495 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  27 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  30.06 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  28.16 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  28.76 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  27.95 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  29.82 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  26.4 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  30.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  26.86 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  26.62 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  28.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  25.9 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  26.52 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  27.88 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  27.88 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  27.81 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  22.05 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  24.43 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  24.43 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  27.87 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  28.16 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  27.61 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  25.49 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  26.06 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  28.35 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  27.1 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 		 207 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  24.81 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>