92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0385 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 186 aa  357  6e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  36.17 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  42.14 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  40.96 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  36.41 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  37.63 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  37.1 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  35.95 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  36.6 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  34.64 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  30.61 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  34.64 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  31.12 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  34.64 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  33.99 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  32.82 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  33.99 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  34.64 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  37.5 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  37.87 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  36.31 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  35.33 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  37.93 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  34.01 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  30.3 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  37.36 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  37.36 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  36.78 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  36.78 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  37.36 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  36.78 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  28.8 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  31.61 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  31.67 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  27.81 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  29.41 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  31.63 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  26.73 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  38.02 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  29.12 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  37.91 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  36.84 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.03 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  28.5 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  25.25 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  25.95 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  28.26 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  29.61 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  29.69 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  33.88 
 
 		 495 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  25.25 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  31.32 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  31.25 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  31.85 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  28.96 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  26.8 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  28.42 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  28.8 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  28.26 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  29.19 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  26.14 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  27.89 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.89 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3687  outer membrane lipoprotein LolB  29.69 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0163127  normal  0.471305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3461  outer membrane lipoprotein LolB  27.87 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0667609  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  25.54 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  32.64 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  25.16 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  19.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0721  outer membrane lipoprotein LolB  25.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0885014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  24.69 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  24.03 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0998  outer membrane lipoprotein LolB  21.19 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  33.64 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  23.38 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  30 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  22.89 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  30.33 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>