83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0291 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  73.27 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  51.53 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  51.96 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  50.51 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  46.75 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  45.61 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  42.16 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  46.15 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  46.15 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  46.15 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  44.97 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  44.97 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  45.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  42.69 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  41.82 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  41.21 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  34.01 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  31.07 
 
 		 247 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  32.37 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  32.35 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  34.25 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  36.69 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  30.61 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  29.23 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  27.27 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  32.72 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  32.21 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  32.21 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  32.21 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  32.21 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  33.09 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  26.67 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  33.09 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  31.18 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  30.73 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  26.19 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  31.82 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  31.72 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  32.89 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  24.16 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  33.02 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  28.82 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  29.53 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  26.76 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  26.76 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  28.32 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  30.88 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  32.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  32.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.81 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  30.28 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  30.82 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  30.82 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  27.49 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  30.14 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  22.16 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  38.82 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  28.79 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  20.89 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  23.65 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  25.75 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  23.65 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  24.46 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  25.17 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  25.26 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  27.27 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  32.39 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  23.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  23.17 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>